自闭症(孤独症)的成因复杂，通常由遗传、环境、神经发育及免疫系统异常等多因素共同作用导致，具体如下：

遗传因素

自闭症具有明显的家族聚集性，同卵双胞胎共患率显著高于异卵双胞胎。目前已发现数百个基因变异与自闭症相关，如SHANK3、NLGN3/4X等基因异常可能影响神经元突触功能，导致神经传导障碍。部分遗传疾病如苯丙酮尿症、脆性X染色体综合征也常伴有孤独症状。

环境因素

孕期感染(如风疹病毒、巨细胞病毒)可能干扰胎儿神经系统发育，增加自闭症风险。孕期接触有害物质(如有机磷农药、重金属铅汞)或空气污染，也可能损害胎儿脑发育。此外，高龄父母生育、孕期使用丙戊酸钠等抗癫痫药物，也与发病相关。

神经发育异常

影像学研究显示，自闭症患者存在大脑连接异常，特别是额叶、颞叶等社交认知相关脑区。小脑体积减小、杏仁核发育异常等结构改变，可能导致情绪处理和社交认知障碍。这些异常多在胎儿期就已形成，影响神经元连接的形成。

免疫系统异常

部分自闭症患者存在免疫缺陷或慢性炎症状态。母体孕期感染可能通过细胞因子影响胎儿大脑发育，导致胎儿神经系统受损。研究发现，自闭症患者脑脊液中炎症因子水平升高，提示神经炎症可能参与发病过程。此外，肠道菌群紊乱也可能通过肠脑轴影响神经功能。