儿童矮小症可能由遗传、营养、内分泌、慢性疾病及心理社会因素引起，具体如下：

遗传因素：遗传是影响儿童身高的关键因素，约70%的身高差异由遗传决定。若父母身材矮小，孩子可能因遗传相关基因出现矮小症，表现为生长速度正常但整体身高低于同龄人。此外，家族中存在特发性矮小、遗传性骨骼发育异常等疾病，也可能使孩子遗传致病基因，导致生长发育迟缓。

营养因素：长期营养摄入不足或不均衡，会严重影响孩子生长发育。蛋白质、钙、磷、维生素D等是骨骼生长的必需营养物质，缺乏这些营养会导致骨骼发育不良。挑食、偏食、过度节食，或因家庭经济条件、喂养方式不当，使孩子无法获取足够营养，阻碍身体正常生长，导致身高增长缓慢。

内分泌因素：生长激素由垂体分泌，对儿童生长发育至关重要。垂体发育异常、肿瘤或外伤等原因，可能导致生长激素分泌不足或缺乏，进而引发矮小症。此外，甲状腺功能减退会使甲状腺激素分泌不足，影响全身新陈代谢和神经系统发育，导致生长迟缓。

慢性疾病因素：先天性心脏病、慢性肾病、消化系统疾病等慢性疾病，会消耗机体能量、影响营养吸收与利用，长期患病可抑制生长发育，导致身高增长迟缓。

心理社会因素：家庭环境紧张、父母关系不和睦、孩子遭受虐待等精神心理因素，可能影响生长激素的分泌，从而对身高产生一定影响。长期焦虑、抑郁等负面情绪也可能对身高发育产生负面影响。